More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0723 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  100 
 
 
511 aa  1054    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  27.31 
 
 
384 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2923  beta-lactamase  26.39 
 
 
423 aa  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.633134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  28.02 
 
 
613 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.54 
 
 
635 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  27.49 
 
 
437 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.23 
 
 
711 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.12 
 
 
796 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.12 
 
 
796 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  27.13 
 
 
419 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.69 
 
 
367 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.87 
 
 
433 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  32.52 
 
 
588 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.02 
 
 
669 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.25 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.41 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  29.96 
 
 
398 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  28.57 
 
 
694 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  30.51 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.36 
 
 
691 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  32.85 
 
 
633 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  29.27 
 
 
386 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  26.7 
 
 
370 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.1 
 
 
533 aa  97.8  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
513 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.92 
 
 
595 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  25.54 
 
 
388 aa  97.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  33.02 
 
 
403 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  30.17 
 
 
691 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30.54 
 
 
513 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.09 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  27.46 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  30.94 
 
 
519 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  24.55 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  29.75 
 
 
691 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  29.75 
 
 
691 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  25.45 
 
 
395 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  29.26 
 
 
691 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  28 
 
 
694 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  27.43 
 
 
410 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  30.19 
 
 
614 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.57 
 
 
691 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.12 
 
 
582 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  24.94 
 
 
397 aa  94  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  24.5 
 
 
395 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.27 
 
 
388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.64 
 
 
453 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  30.51 
 
 
479 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.63 
 
 
610 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  33.78 
 
 
341 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  28.57 
 
 
513 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.25 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.56 
 
 
513 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  26.09 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  25 
 
 
388 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  31.16 
 
 
481 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25 
 
 
389 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  24.73 
 
 
388 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  25 
 
 
388 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  27.14 
 
 
420 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  25 
 
 
388 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  32.24 
 
 
400 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  27.38 
 
 
424 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  32.91 
 
 
340 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  25.85 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  33.47 
 
 
341 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.14 
 
 
580 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  25.69 
 
 
417 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  30.18 
 
 
694 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  30.37 
 
 
420 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  28.62 
 
 
418 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  22.87 
 
 
420 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  25.57 
 
 
427 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  22.87 
 
 
420 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  31.37 
 
 
559 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  30.81 
 
 
481 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  33.49 
 
 
480 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  32.63 
 
 
383 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  25.99 
 
 
424 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.09 
 
 
578 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  31.67 
 
 
695 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30.33 
 
 
481 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30.33 
 
 
481 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  25.82 
 
 
410 aa  87.4  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  30.33 
 
 
463 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.13 
 
 
388 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.88 
 
 
637 aa  87.4  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  31.32 
 
 
423 aa  87.4  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  26.65 
 
 
392 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  25.82 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.51 
 
 
415 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.58 
 
 
681 aa  86.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  25.07 
 
 
422 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  32.05 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  32.05 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.97 
 
 
488 aa  86.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  25.85 
 
 
420 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  27.54 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  24.2 
 
 
377 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>