More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1301 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  100 
 
 		 417 aa  795    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  38.04 
 
 		 494 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  43.42 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  41.58 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  39.07 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.71 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  30.03 
 
 		 498 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  33.33 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  29.25 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  30.14 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.74 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  28.23 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  30.26 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  30.26 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  40.65 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  30.8 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  35.79 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  34.97 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  29.93 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  30.9 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  28.95 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  29.28 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  28.95 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  28.95 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  28.62 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  28.95 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  31.4 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  31.4 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  31.4 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  29.64 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  34.87 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  32.34 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  30.23 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  33 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  33 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  31.29 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  26.94 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  32.67 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  30.51 
 
 		 493 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1624  beta-lactamase  28.85 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000378286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  31.83 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.64 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.66 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  32.45 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.91 
 
 		 595 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  30.82 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.14 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  30.69 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30.82 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  29.82 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.12 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.3 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  28.67 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  28.62 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  30.16 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.58 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  28.15 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  26.77 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.81 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.56 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  28.33 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  29.67 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  27.81 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  29.15 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  27.81 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  31.85 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  29.19 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  28.71 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  31.49 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  28.82 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.13 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.42 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23.83 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  29.81 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.08 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2704  beta-lactamase  29.08 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  31.9 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.41 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.64 
 
 		 720 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  27.85 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.51 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  27.42 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.72 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5304  beta-lactamase  32.41 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.77 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.92 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.38 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26.17 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  34.32 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.95 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  28.96 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  31.32 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>