More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3840 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  97.08 
 
 		 377 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  100 
 
 		 377 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  97.08 
 
 		 377 aa  754    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  97.88 
 
 		 377 aa  759    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  97.08 
 
 		 377 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  98.14 
 
 		 377 aa  762    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  97.35 
 
 		 377 aa  754    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  98.14 
 
 		 377 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  97.08 
 
 		 377 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  76.84 
 
 		 409 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  76.84 
 
 		 409 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  72.89 
 
 		 385 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  46.9 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  43.95 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  43.72 
 
 		 397 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  44.35 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  44.21 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  42.82 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  43.82 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  43.88 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  42.41 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  40.79 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  40.32 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  43.1 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  40.26 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  41.51 
 
 		 387 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  41.11 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  40.05 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  43.54 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  41.71 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  43.54 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  43.54 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  39.11 
 
 		 394 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  39.37 
 
 		 394 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  44.23 
 
 		 384 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  41.18 
 
 		 417 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  41.46 
 
 		 417 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  42.54 
 
 		 389 aa  298  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  42.02 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  39.11 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  38.18 
 
 		 401 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  43.04 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  39.83 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  38.32 
 
 		 394 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  40.86 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  42.69 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  41.88 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  39.71 
 
 		 378 aa  282  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  41.53 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  40 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  39.5 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  39.94 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  39.39 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  39.53 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  38.23 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  40.07 
 
 		 315 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  35.64 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.73 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.27 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.48 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.03 
 
 		 460 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.65 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.4 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  26.68 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  27.27 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.42 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  27.19 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  26.68 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  24.93 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.82 
 
 		 514 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  24.5 
 
 		 635 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.65 
 
 		 482 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.24 
 
 		 1032 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.22 
 
 		 490 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.73 
 
 		 505 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  27.22 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  26.3 
 
 		 498 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.55 
 
 		 636 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.48 
 
 		 483 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.26 
 
 		 1055 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.6 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.43 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.42 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.3 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  26.65 
 
 		 674 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  29.13 
 
 		 475 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.82 
 
 		 543 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.82 
 
 		 543 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.93 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.76 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.85 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  24.78 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.68 
 
 		 533 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.86 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.75 
 
 		 650 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.96 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.47 
 
 		 481 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.68 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>