More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3723 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  100 
 
 		 388 aa  794    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  60.82 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  59.02 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  57.25 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  57.65 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  57.91 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  56.41 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  51.99 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  52.26 
 
 		 387 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  54.34 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  48.21 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  49.58 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  48.49 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  48.91 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  47.63 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  49.3 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  49.18 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  48.63 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  49.86 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  48.91 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  48.78 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  48.75 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  47.17 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  51.85 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  49.72 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  48.57 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  47.75 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  51.8 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  46.88 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  46.88 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  51.8 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  47.62 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  47.18 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  51.8 
 
 		 380 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  47.17 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  46.9 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  46.9 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  49.16 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  49.16 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  49.16 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  46.09 
 
 		 377 aa  348  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  46.09 
 
 		 377 aa  348  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  45.28 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  46.63 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  47.27 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  46.09 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  45.82 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  45.82 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  45.38 
 
 		 389 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  45.92 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  45.1 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  44.89 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  40.16 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  44.3 
 
 		 315 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  40.29 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  39.77 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  36.53 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.08 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.68 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  28.69 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  25.28 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  27.09 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  23.3 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  24.74 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  24.46 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  25.88 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  25.32 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.68 
 
 		 520 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.94 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.73 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.81 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.66 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.21 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  26.25 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.3 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  31.25 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.51 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  26.3 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  26.21 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  33.13 
 
 		 166 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25.36 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  24.37 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  23.29 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.21 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  24.13 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.4 
 
 		 1032 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  22.88 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.54 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.95 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25 
 
 		 1055 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  24.56 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  22.87 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.88 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  26.04 
 
 		 711 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  29.05 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.08 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  32.16 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.81 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  25 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1624  beta-lactamase  28.24 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000378286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>