More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2695 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  100 
 
 		 385 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  74.34 
 
 		 384 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  59.06 
 
 		 391 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  61.5 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  53.51 
 
 		 389 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  51.95 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  50.53 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  54.73 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  50.67 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  50.13 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  49.47 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  50.53 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  50.91 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  53.58 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  54.62 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  51.32 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  53.3 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  53.3 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  51.27 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  51.97 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  49.72 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  50 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  48.81 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  51.93 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  49.86 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  47.79 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  47.85 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  47.18 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  47.31 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  48.47 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  47.11 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  48.02 
 
 		 378 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  45.48 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  44.62 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  46.72 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  46.74 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  44.21 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  45.76 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  45.48 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  45.48 
 
 		 380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  44.02 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  41.4 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  41.4 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  41.4 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  40.86 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  41.4 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  40.59 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  41.13 
 
 		 377 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  40.86 
 
 		 377 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  40.27 
 
 		 377 aa  288  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  40.37 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  39.1 
 
 		 409 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  39.1 
 
 		 409 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  40.67 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  45.39 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  37.53 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  35.11 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.9 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.1 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  37.06 
 
 		 166 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.57 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  23.85 
 
 		 482 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  23.8 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  23.85 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.05 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.08 
 
 		 669 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  22.92 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.21 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  25.58 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  24.64 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  28.73 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  23.8 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.78 
 
 		 1055 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.57 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.52 
 
 		 513 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.22 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.5 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  23.26 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  25.29 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.96 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.92 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.1 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  25.63 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  24.7 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  29.09 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.76 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  22.67 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.6 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  23.01 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  30.52 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.77 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.5 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  24.22 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  24.22 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  24.22 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  24.22 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  24.22 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  22.53 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.56 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>