More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1856 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  100 
 
 		 498 aa  1011    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  33.15 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  30.91 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  34.01 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  27.6 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  27.91 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  30.84 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  32.8 
 
 		 381 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  31.54 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  31.13 
 
 		 373 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.4 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.06 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.25 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.63 
 
 		 822 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.28 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.62 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.4 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.02 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.27 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.36 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.18 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.06 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  32.23 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.79 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  25.28 
 
 		 388 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  25.87 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.57 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  28.48 
 
 		 397 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  24.88 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.17 
 
 		 539 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.95 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  25.41 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.94 
 
 		 544 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  29.39 
 
 		 385 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.11 
 
 		 485 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  27.87 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  27.87 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  29.39 
 
 		 385 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.66 
 
 		 485 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  26.68 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.66 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.11 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.23 
 
 		 595 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25 
 
 		 616 aa  96.7  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  27.87 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  26.81 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  29.08 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  27.18 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.82 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.82 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  26.52 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  26.52 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  26.26 
 
 		 378 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  23.97 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  26.52 
 
 		 383 aa  94.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.27 
 
 		 504 aa  94  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  28.05 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  27.52 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  23.61 
 
 		 381 aa  93.6  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  29.18 
 
 		 524 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  30.77 
 
 		 447 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  26.3 
 
 		 377 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.15 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  27.74 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  25.25 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  26.15 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  26.15 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  26.21 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  27.74 
 
 		 385 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.49 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  22.5 
 
 		 1055 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  28.72 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.78 
 
 		 485 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  27.01 
 
 		 404 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  30.39 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.66 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.61 
 
 		 650 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  25.95 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  25.68 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  28.77 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  30.39 
 
 		 385 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.21 
 
 		 377 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  30.64 
 
 		 467 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  26.43 
 
 		 451 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  28.4 
 
 		 380 aa  90.1  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  32.29 
 
 		 446 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  25.56 
 
 		 523 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  31.34 
 
 		 463 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  25.16 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  25 
 
 		 394 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.2 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  30.37 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  25.25 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>