More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2481 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  100 
 
 		 359 aa  733    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  96.1 
 
 		 359 aa  705    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  29.55 
 
 		 383 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  30.26 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  29.79 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  28.49 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  29.52 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  29.15 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  29.15 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  29.36 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  28.53 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  27.68 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  27.67 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  28.9 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  29.39 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  28.64 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  28.53 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  28.41 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  32.74 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  27.51 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  29.48 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27.93 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  31.93 
 
 		 401 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  29.6 
 
 		 394 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  31.29 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  30.09 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.27 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  26.4 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  27.01 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  29.31 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  27.01 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  26.58 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  27.08 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  27.54 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.47 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  27.79 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.68 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  27.09 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  27.59 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  28.16 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  28.45 
 
 		 378 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  27.57 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  26.98 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  26.86 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  26.96 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  26.9 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  28.21 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  27.51 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  25.07 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  27.45 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  26.08 
 
 		 409 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  26.08 
 
 		 409 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  27.27 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  27.27 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  29.21 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  30 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  26.42 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  27.08 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  27.93 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  29.3 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.47 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  30.5 
 
 		 635 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  25.72 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  28.84 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.27 
 
 		 1032 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  26.07 
 
 		 498 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  26.7 
 
 		 491 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.94 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  25.62 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.45 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  26.45 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  28.53 
 
 		 365 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  26.26 
 
 		 455 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.26 
 
 		 455 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  24.93 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  24.63 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.32 
 
 		 485 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.23 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  27.51 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.91 
 
 		 485 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  23.43 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  29.63 
 
 		 677 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.11 
 
 		 650 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.65 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  27.68 
 
 		 614 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.61 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.15 
 
 		 460 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  27.73 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.35 
 
 		 578 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  27.16 
 
 		 478 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  29.3 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.48 
 
 		 530 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.88 
 
 		 485 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.63 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.61 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25 
 
 		 498 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.7 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>