More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1776 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  100 
 
 		 390 aa  797    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  65.18 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  58.76 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  57.25 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  60.5 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  60.78 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  57.94 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  54.52 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  55 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  56.77 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  51.17 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  53.56 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  51.32 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  53.16 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  48.4 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  49.72 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  50.28 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  52.25 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  49.3 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  49.72 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  50 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  51.68 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  49.72 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  50.26 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  51.69 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  51.69 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  50.84 
 
 		 389 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  50.7 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  47.75 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  46.9 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  46.18 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  46.4 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  47.22 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  46.81 
 
 		 378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  49.72 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  44.09 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  45.38 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  45.38 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  44.21 
 
 		 377 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  43.95 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  44.21 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  43.95 
 
 		 377 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  43.68 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  43.68 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  48.31 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  44.95 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  44.94 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  48.31 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  43.42 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  43.68 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  47.11 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  48.55 
 
 		 387 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  43.9 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  48.38 
 
 		 315 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  43.64 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  41.88 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  33.6 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  30.92 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  30.26 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.97 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.26 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.06 
 
 		 460 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  26.52 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  25.77 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.57 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.15 
 
 		 803 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.32 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.87 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  27.08 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.9 
 
 		 650 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.25 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  23.4 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.23 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  27.27 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.97 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.64 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  24.46 
 
 		 603 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  30.56 
 
 		 636 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.17 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.89 
 
 		 669 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  35.23 
 
 		 166 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.27 
 
 		 1032 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  29.09 
 
 		 658 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.35 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.79 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.27 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  25.47 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  24.07 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.04 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  22.44 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.15 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  25 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  22.85 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.43 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.27 
 
 		 635 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  24.92 
 
 		 496 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  31.78 
 
 		 657 aa  73.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.54 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.97 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>