More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1758 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  100 
 
 		 387 aa  771    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  94.32 
 
 		 387 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  79.06 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  60.78 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  55.24 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  51.99 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  53.79 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  54.52 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  52.96 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  49.58 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  48.04 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  46.75 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  50.57 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  44.59 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  45.48 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  44.1 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  42.93 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  44.38 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  47.49 
 
 		 389 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  43.7 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  44.48 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  44.76 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  43.91 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  47.9 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  45.33 
 
 		 383 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  44.19 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  49.28 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  47.46 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  41.87 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  49 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  49 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  42.97 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  41.9 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  43.59 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  44.01 
 
 		 385 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  47.24 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  46.83 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  46.94 
 
 		 389 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  46.94 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  47.46 
 
 		 380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  42.04 
 
 		 377 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  43.08 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  43.08 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  41.78 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  47.01 
 
 		 401 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  41.78 
 
 		 377 aa  316  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  41.51 
 
 		 377 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  43.1 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  41.25 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  40.99 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  40.99 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  46.11 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  41.25 
 
 		 377 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  47.06 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  43.48 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  43.54 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  34.99 
 
 		 381 aa  225  8e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  29.52 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.26 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.01 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  27.79 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.85 
 
 		 460 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  28.61 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.78 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  31.68 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.02 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.74 
 
 		 514 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  26.1 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.11 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  26.86 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  28.12 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.4 
 
 		 513 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.38 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.6 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.6 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.94 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.55 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.44 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.31 
 
 		 834 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.15 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.84 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  31.27 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  22.09 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  26.24 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.09 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.56 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  28.19 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  30.37 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  22.84 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.87 
 
 		 539 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.72 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.53 
 
 		 601 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.31 
 
 		 650 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.15 
 
 		 600 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.3 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.93 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.97 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  25.62 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  28.74 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>