More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4638 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  100 
 
 		 390 aa  807    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  43.27 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  41.4 
 
 		 491 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  35.59 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  35.8 
 
 		 504 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  32.93 
 
 		 498 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  32.77 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  30.31 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  29.21 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  30.41 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  28.57 
 
 		 498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  29.13 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.62 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  27.62 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  27.62 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  26.69 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.19 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  28.07 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  27.78 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  26.32 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.92 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.32 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  26.32 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.61 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  26.32 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.41 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  26.54 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  26.69 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  26.69 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  26.12 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  27.99 
 
 		 543 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  27.99 
 
 		 543 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.27 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.45 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.45 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  26.04 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.04 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  28.08 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  29.59 
 
 		 474 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  25.76 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  24.65 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  24.67 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.16 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  26.24 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  32.83 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  25.88 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  24.74 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  24.62 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  28.57 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.26 
 
 		 342 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  27.62 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  28.08 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  27.12 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.63 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  26.71 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  26.71 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  26.71 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.38 
 
 		 453 aa  90.1  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  25.27 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  26.78 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.3 
 
 		 595 aa  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  23.83 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  24.86 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.34 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  24.93 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  24.08 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.71 
 
 		 505 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  25.38 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  24.66 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  24.66 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.08 
 
 		 533 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.13 
 
 		 662 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.63 
 
 		 633 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.78 
 
 		 578 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  24.4 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  24.59 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  24.66 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.05 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  26.05 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.92 
 
 		 559 aa  86.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.23 
 
 		 513 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  24.25 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  27.16 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.33 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.63 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  24.65 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  22.73 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  24.22 
 
 		 635 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  25 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  26.91 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.18 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  29.05 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  24.59 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  26.2 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  26.62 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.5 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  24.31 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  24.76 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.21 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>