More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1671 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  100 
 
 		 633 aa  1279    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  42.21 
 
 		 661 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  41.32 
 
 		 674 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  37.16 
 
 		 635 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  33.49 
 
 		 650 aa  287  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.45 
 
 		 669 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  33.01 
 
 		 533 aa  243  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.34 
 
 		 662 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  36.45 
 
 		 657 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  29.35 
 
 		 658 aa  237  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  34.1 
 
 		 778 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  34.72 
 
 		 677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  31.98 
 
 		 636 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  31.2 
 
 		 695 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.48 
 
 		 717 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  24.22 
 
 		 638 aa  150  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.29 
 
 		 637 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  31.78 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.76 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.76 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.64 
 
 		 513 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.77 
 
 		 513 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.3 
 
 		 539 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 513 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.78 
 
 		 362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  32.45 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  26.37 
 
 		 383 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.57 
 
 		 453 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  32.07 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.38 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  29.2 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.94 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.57 
 
 		 505 aa  109  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.96 
 
 		 601 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.12 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.79 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.18 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.09 
 
 		 614 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.43 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.25 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.92 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.18 
 
 		 600 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.15 
 
 		 392 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  30.75 
 
 		 440 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  29.43 
 
 		 375 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  30.74 
 
 		 409 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.91 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.22 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.68 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.13 
 
 		 378 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.97 
 
 		 567 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 630 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  28.19 
 
 		 580 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.18 
 
 		 834 aa  100  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  30.71 
 
 		 524 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  31.7 
 
 		 375 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 421 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  23.9 
 
 		 1055 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.4 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.36 
 
 		 421 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  31.65 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 412 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.45 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.94 
 
 		 434 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.62 
 
 		 375 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  28.63 
 
 		 496 aa  99  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.46 
 
 		 476 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.65 
 
 		 455 aa  98.2  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.05 
 
 		 364 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  26.35 
 
 		 610 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 412 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 377 aa  98.2  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  33.18 
 
 		 416 aa  97.8  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 377 aa  98.2  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 377 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  32.85 
 
 		 511 aa  97.8  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.84 
 
 		 422 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.76 
 
 		 520 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  28.99 
 
 		 405 aa  97.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.81 
 
 		 437 aa  97.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.31 
 
 		 375 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.55 
 
 		 488 aa  96.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.75 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.31 
 
 		 377 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  32.6 
 
 		 416 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  25.27 
 
 		 405 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  32.47 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  28.24 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.57 
 
 		 413 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.92 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.34 
 
 		 499 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.99 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  32.84 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.87 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.33 
 
 		 481 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.69 
 
 		 481 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.17 
 
 		 530 aa  95.1  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.84 
 
 		 966 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>