More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4682 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  96.29 
 
 		 377 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  98.14 
 
 		 377 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  96.29 
 
 		 377 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  96.29 
 
 		 377 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  97.35 
 
 		 377 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  96.02 
 
 		 377 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  96.55 
 
 		 377 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  96.29 
 
 		 377 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  100 
 
 		 377 aa  776    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  76.84 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  76.84 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  72.89 
 
 		 385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  47.17 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  44.21 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  43.98 
 
 		 397 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  44.63 
 
 		 378 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  43.08 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  44.1 
 
 		 386 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  44.21 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  42.67 
 
 		 397 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  43.38 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  43.62 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  41.78 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  40.79 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  40.53 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  41.11 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  40.05 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  45.3 
 
 		 384 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  43.31 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  43.26 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  39.78 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  41.44 
 
 		 385 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  42.3 
 
 		 389 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  39.11 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  39.37 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  43.26 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  43.26 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  40.9 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  41.18 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  39.11 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  38.32 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  37.66 
 
 		 401 aa  292  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  41.97 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  39.28 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  40.59 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  41.6 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  41.83 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  39.71 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  40.28 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  41.26 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  40.22 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  39.78 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  39.66 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  39.43 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  37.95 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  40.07 
 
 		 315 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  34.31 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.15 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.93 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.27 
 
 		 494 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.46 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  27 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.4 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.4 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  28.07 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  26.75 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.22 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  24.93 
 
 		 482 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.18 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.65 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.52 
 
 		 1032 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25.67 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  26.68 
 
 		 498 aa  96.3  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  27.51 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.06 
 
 		 505 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.08 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.42 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.92 
 
 		 636 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.89 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.48 
 
 		 483 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.98 
 
 		 1055 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.15 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.15 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.68 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.34 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.35 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.3 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  29.13 
 
 		 475 aa  89.4  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.76 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  30.49 
 
 		 543 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  30.49 
 
 		 543 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  25.07 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.88 
 
 		 848 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  22.47 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.68 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  24.21 
 
 		 635 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  23.66 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  23.66 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  23.66 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  23.66 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>