More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5423 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  100 
 
 		 636 aa  1265    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  32.63 
 
 		 633 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  31.41 
 
 		 650 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  32.03 
 
 		 661 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.36 
 
 		 669 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.27 
 
 		 658 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  33.57 
 
 		 677 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.49 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  33.81 
 
 		 778 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  24.67 
 
 		 662 aa  181  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  31.67 
 
 		 674 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.37 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.72 
 
 		 637 aa  170  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.11 
 
 		 717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  32.81 
 
 		 657 aa  164  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  32.17 
 
 		 695 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  33.73 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  29.27 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.37 
 
 		 513 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.28 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.9 
 
 		 601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.95 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.03 
 
 		 498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  32.17 
 
 		 616 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  30.91 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.91 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.74 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.12 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  27.25 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.04 
 
 		 595 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.67 
 
 		 446 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.84 
 
 		 486 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  30.28 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  31.75 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.93 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.71 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  31.23 
 
 		 464 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.4 
 
 		 356 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.23 
 
 		 544 aa  100  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  35.15 
 
 		 416 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  24.68 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  28.94 
 
 		 1055 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.07 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.08 
 
 		 342 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.53 
 
 		 487 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.21 
 
 		 389 aa  97.8  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  32.43 
 
 		 480 aa  97.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.24 
 
 		 405 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.67 
 
 		 501 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.05 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  29.68 
 
 		 613 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  23.31 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.49 
 
 		 505 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.3 
 
 		 421 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.51 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.17 
 
 		 389 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.93 
 
 		 392 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.76 
 
 		 470 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 421 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.22 
 
 		 485 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 412 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.28 
 
 		 498 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.28 
 
 		 498 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.71 
 
 		 377 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.16 
 
 		 803 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.03 
 
 		 422 aa  94  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.15 
 
 		 455 aa  94  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 412 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.89 
 
 		 388 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.12 
 
 		 578 aa  93.6  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 413 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.77 
 
 		 369 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.99 
 
 		 478 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.11 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.8 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.93 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  29.92 
 
 		 377 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.28 
 
 		 539 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  25.57 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  29.19 
 
 		 466 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  26.22 
 
 		 398 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  25.95 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.38 
 
 		 485 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.47 
 
 		 388 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  29.55 
 
 		 377 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.41 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.41 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.75 
 
 		 711 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.38 
 
 		 453 aa  92  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.43 
 
 		 461 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.07 
 
 		 485 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  29.92 
 
 		 377 aa  91.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  29.55 
 
 		 377 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.28 
 
 		 407 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  30.37 
 
 		 416 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.95 
 
 		 431 aa  90.9  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  25.74 
 
 		 380 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.8 
 
 		 519 aa  90.9  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.32 
 
 		 364 aa  90.9  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>