More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0784 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  100 
 
 
638 aa  1286    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  35.06 
 
 
650 aa  319  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  34.09 
 
 
778 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  32.22 
 
 
635 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.12 
 
 
669 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.27 
 
 
533 aa  195  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  30.24 
 
 
657 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  24.12 
 
 
662 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  28.11 
 
 
661 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.02 
 
 
658 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  31.79 
 
 
674 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  34.55 
 
 
695 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  25.04 
 
 
633 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.85 
 
 
717 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  28.92 
 
 
677 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  23.65 
 
 
637 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.27 
 
 
636 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  28.47 
 
 
422 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.72 
 
 
519 aa  98.2  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.96 
 
 
480 aa  97.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  28.01 
 
 
466 aa  96.3  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.95 
 
 
483 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.13 
 
 
588 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.89 
 
 
403 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  27.42 
 
 
481 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  27.42 
 
 
481 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.46 
 
 
513 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  30.41 
 
 
481 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.28 
 
 
559 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  26.48 
 
 
507 aa  91.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  30.41 
 
 
463 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.41 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.67 
 
 
539 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  25.99 
 
 
566 aa  89  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  23.66 
 
 
601 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.69 
 
 
342 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  22.53 
 
 
519 aa  88.2  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.84 
 
 
529 aa  87.8  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.55 
 
 
514 aa  87.4  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.77 
 
 
616 aa  87.4  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25 
 
 
526 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  24.92 
 
 
405 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.21 
 
 
507 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  28.64 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.27 
 
 
513 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  28.87 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.58 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.81 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.12 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.35 
 
 
803 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.96 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  29.66 
 
 
457 aa  84  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.58 
 
 
453 aa  84  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  22.38 
 
 
614 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.23 
 
 
485 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.96 
 
 
412 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.67 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.96 
 
 
412 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.3 
 
 
590 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.6 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  23.3 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.67 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.44 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.95 
 
 
1055 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.51 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.42 
 
 
421 aa  82  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  29.96 
 
 
391 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.08 
 
 
477 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  33.33 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.67 
 
 
595 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.73 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.96 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  28.12 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.65 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.44 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.44 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  23.27 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  23.56 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  24.62 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.65 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.42 
 
 
413 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.61 
 
 
460 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.59 
 
 
544 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  29.89 
 
 
416 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.41 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.49 
 
 
530 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.41 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.21 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.43 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.93 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  28.85 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.85 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  27.76 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  24.57 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  28.45 
 
 
478 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  28.94 
 
 
397 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.74 
 
 
520 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.13 
 
 
501 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>