More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4139 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  100 
 
 
422 aa  866    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  40.43 
 
 
650 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  35.66 
 
 
778 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  35.94 
 
 
658 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  31.12 
 
 
533 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  32.39 
 
 
669 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  34.33 
 
 
635 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  33.68 
 
 
657 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  36.46 
 
 
695 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  32.59 
 
 
677 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  31.75 
 
 
674 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  31.3 
 
 
717 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  34.25 
 
 
636 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  28.47 
 
 
638 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  30.45 
 
 
633 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.28 
 
 
637 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  31.54 
 
 
601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  29.61 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  28.32 
 
 
600 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.57 
 
 
595 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.02 
 
 
588 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  30.61 
 
 
661 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  32.07 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.46 
 
 
498 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  27.04 
 
 
574 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.13 
 
 
1055 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.7 
 
 
505 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.53 
 
 
616 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  26.83 
 
 
610 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.47 
 
 
513 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  34.15 
 
 
711 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  32.21 
 
 
464 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28 
 
 
513 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  29.73 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  33.16 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.98 
 
 
681 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.91 
 
 
513 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.78 
 
 
539 aa  87  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
630 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  27.6 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.78 
 
 
499 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.38 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.51 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.51 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  26.75 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.78 
 
 
582 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.14 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.59 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.08 
 
 
591 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.14 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.57 
 
 
342 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  26.32 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  29.53 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.44 
 
 
513 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.32 
 
 
481 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.43 
 
 
578 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.5 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  27.99 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.46 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.84 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.52 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.57 
 
 
966 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  30 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.1 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.01 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  30.6 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.64 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.71 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  23.08 
 
 
614 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  24.55 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  24.55 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  24.55 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.01 
 
 
525 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  26.21 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  24.55 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.42 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.32 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  25.35 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.81 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.1 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.62 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  30.38 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.43 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.43 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  27.62 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.43 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.43 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.2 
 
 
530 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  22.99 
 
 
431 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.43 
 
 
422 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  24.74 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  25.33 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  25.43 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  26.32 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  27.87 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  23.95 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.32 
 
 
559 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  27.49 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  28.19 
 
 
446 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  29.73 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>