More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4833 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  100 
 
 
405 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  41.48 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  34.1 
 
 
513 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  33.95 
 
 
513 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  35.05 
 
 
513 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  35.65 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  39.19 
 
 
285 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  32.85 
 
 
580 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  30.88 
 
 
398 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.86 
 
 
389 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.39 
 
 
483 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  31.15 
 
 
507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  29.8 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  29.77 
 
 
410 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  28 
 
 
410 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  27.66 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  29.67 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.12 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.96 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.96 
 
 
481 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.96 
 
 
481 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.41 
 
 
483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.67 
 
 
669 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.61 
 
 
463 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  27.54 
 
 
490 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  30.31 
 
 
5698 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.32 
 
 
662 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.84 
 
 
476 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.09 
 
 
481 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.27 
 
 
445 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  32.11 
 
 
711 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  24.93 
 
 
483 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  31.05 
 
 
391 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.2 
 
 
650 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  26.28 
 
 
483 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.37 
 
 
466 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.92 
 
 
365 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  27.96 
 
 
677 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  28.3 
 
 
419 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.82 
 
 
392 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  27.4 
 
 
345 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  28.01 
 
 
600 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.24 
 
 
637 aa  99.4  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  28.74 
 
 
657 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  26.91 
 
 
345 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.41 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.34 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  28.2 
 
 
695 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  26.91 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.15 
 
 
578 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  29.23 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  27.41 
 
 
345 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  27.61 
 
 
340 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  29.48 
 
 
361 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.61 
 
 
455 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.28 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.09 
 
 
633 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.06 
 
 
505 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  26.84 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  26.84 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.58 
 
 
497 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.57 
 
 
601 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.56 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.44 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.44 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  29.17 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  25.21 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  27.13 
 
 
340 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.43 
 
 
681 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  26.42 
 
 
395 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  26.5 
 
 
525 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.62 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  26.09 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  28.41 
 
 
555 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.01 
 
 
395 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  28.06 
 
 
636 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  30.93 
 
 
514 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.88 
 
 
353 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.83 
 
 
834 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  26.09 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  26.25 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.33 
 
 
658 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.22 
 
 
485 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.33 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  25.55 
 
 
345 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.81 
 
 
477 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  31.47 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  27.59 
 
 
543 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  27.59 
 
 
543 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.52 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.48 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  26.28 
 
 
614 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.76 
 
 
595 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  28.89 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.52 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.52 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.52 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.13 
 
 
559 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>