More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3823 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  100 
 
 		 398 aa  812    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.93 
 
 		 650 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.1 
 
 		 657 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  29.96 
 
 		 511 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  23.2 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.17 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.81 
 
 		 595 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.49 
 
 		 486 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.31 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  24.57 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.7 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.63 
 
 		 483 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.76 
 
 		 485 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.2 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.71 
 
 		 485 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  23.2 
 
 		 485 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.93 
 
 		 601 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.2 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.38 
 
 		 481 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.38 
 
 		 481 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.3 
 
 		 480 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  28.52 
 
 		 525 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.01 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.81 
 
 		 463 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.23 
 
 		 588 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.85 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  22.93 
 
 		 485 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.38 
 
 		 481 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.74 
 
 		 1055 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.75 
 
 		 533 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  22.65 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.95 
 
 		 669 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  22.65 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  26.22 
 
 		 636 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  24.25 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.08 
 
 		 485 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  25.46 
 
 		 711 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.11 
 
 		 490 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.49 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  22.42 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.2 
 
 		 1032 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  29.17 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.03 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  26.67 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  21.45 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  27.38 
 
 		 677 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.57 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.06 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.78 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  25.43 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.47 
 
 		 658 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.3 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  26.74 
 
 		 670 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.03 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  24.6 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  24.27 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  24.72 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  23.97 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  23.3 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.7 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  28.76 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  21.91 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.13 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  26.06 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.12 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  23.39 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.08 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  26.05 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  24.04 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  26.06 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  22.45 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  25.64 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.45 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.4 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.32 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  23.76 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  24.8 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.77 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.32 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.26 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  23.26 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  25.07 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  23.5 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  24.28 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  23.37 
 
 		 524 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  26.06 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  25.33 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.14 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  26.06 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  24.14 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  24.52 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  26.4 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.94 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.78 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.78 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  25 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.78 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  22.86 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>