More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09928 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 		 483 aa  990    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  38.17 
 
 		 580 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  40.85 
 
 		 410 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  39.47 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  40.45 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  40.85 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  42.08 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.25 
 
 		 504 aa  189  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  32.43 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  32.46 
 
 		 345 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  33.01 
 
 		 5698 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  32.72 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 374 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  31.75 
 
 		 345 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  32.62 
 
 		 345 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  33.03 
 
 		 513 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  32.04 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 513 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  33.13 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 513 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  36.48 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  31.39 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  31.34 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  29.67 
 
 		 494 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  30.84 
 
 		 365 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.29 
 
 		 559 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  36.41 
 
 		 423 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.24 
 
 		 610 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.72 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  31.05 
 
 		 600 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.13 
 
 		 507 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.26 
 
 		 669 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.7 
 
 		 543 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.7 
 
 		 543 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.49 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.84 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.16 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.87 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.06 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  25.93 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  26.76 
 
 		 675 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.34 
 
 		 966 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.53 
 
 		 595 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.79 
 
 		 533 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  25.36 
 
 		 715 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  25.74 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.6 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  26.41 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  28.16 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  25 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.25 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  24.48 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  25.54 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.63 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.94 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.78 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28.93 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  34.21 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  26.51 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  30.96 
 
 		 635 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  28.93 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  27.07 
 
 		 778 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.44 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  25.52 
 
 		 711 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  26.92 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.32 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  31.54 
 
 		 662 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.32 
 
 		 588 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  24.72 
 
 		 616 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.72 
 
 		 470 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  27.09 
 
 		 358 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  24.67 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  27.89 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.74 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.83 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.26 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.83 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.16 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.79 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  29.79 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.17 
 
 		 487 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  29.55 
 
 		 395 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.15 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.42 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.78 
 
 		 461 aa  90.5  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25 
 
 		 485 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  28.34 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  29.13 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  30.42 
 
 		 657 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  32.26 
 
 		 525 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.04 
 
 		 1055 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.86 
 
 		 658 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.76 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.44 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>