More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1905 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  100 
 
 		 389 aa  802    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  34.39 
 
 		 580 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  32.68 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  31.05 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  31.37 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  31.37 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  30.11 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  30.81 
 
 		 410 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.58 
 
 		 504 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.04 
 
 		 483 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  33.64 
 
 		 5698 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.86 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  32.65 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.85 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.47 
 
 		 513 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  31.12 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  25.16 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  25.24 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  27.27 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  25.16 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  25.24 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  25.24 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  33.91 
 
 		 285 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  24.21 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  29.15 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.04 
 
 		 601 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  24.92 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  35.27 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.38 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.09 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.38 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  33.47 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  33.61 
 
 		 662 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.11 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.3 
 
 		 595 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  29.52 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.72 
 
 		 669 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.23 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.91 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.17 
 
 		 559 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.36 
 
 		 533 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  27.49 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.14 
 
 		 610 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  38.3 
 
 		 635 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.96 
 
 		 490 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.18 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.24 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  31.8 
 
 		 523 aa  96.7  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.91 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.32 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.76 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  32.38 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.51 
 
 		 834 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  32.38 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.52 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  30.15 
 
 		 862 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  26.75 
 
 		 637 aa  94  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.67 
 
 		 600 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.82 
 
 		 539 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  31.23 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.74 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.74 
 
 		 485 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  25.27 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.74 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.74 
 
 		 485 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.29 
 
 		 675 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.95 
 
 		 497 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  31.84 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.76 
 
 		 681 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.62 
 
 		 524 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  28.71 
 
 		 711 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  30.99 
 
 		 933 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.31 
 
 		 614 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.39 
 
 		 485 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 481 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.84 
 
 		 633 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  28.49 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.04 
 
 		 485 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.36 
 
 		 486 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  31.43 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  32.09 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.07 
 
 		 485 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.25 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.32 
 
 		 485 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.31 
 
 		 588 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  34 
 
 		 674 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.08 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.29 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.52 
 
 		 487 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  23.73 
 
 		 502 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  30 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 630 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.31 
 
 		 658 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  26.38 
 
 		 363 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>