More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1375 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  100 
 
 
491 aa  973    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  33.33 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.83 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  28.95 
 
 
365 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  34.18 
 
 
391 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  30.61 
 
 
513 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  31.84 
 
 
513 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  34.86 
 
 
357 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  30.61 
 
 
513 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  33 
 
 
559 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  30.36 
 
 
555 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  34.57 
 
 
513 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.21 
 
 
483 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  31.31 
 
 
600 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  30.41 
 
 
675 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.88 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  31.07 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.88 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.88 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.22 
 
 
519 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25.22 
 
 
447 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  31.08 
 
 
285 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  30.53 
 
 
610 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.34 
 
 
481 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.88 
 
 
481 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.4 
 
 
635 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.26 
 
 
490 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  30.62 
 
 
674 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.37 
 
 
595 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.68 
 
 
533 aa  90.1  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28.22 
 
 
342 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  24.19 
 
 
483 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  28.09 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.61 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.84 
 
 
499 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  31.31 
 
 
590 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25 
 
 
462 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.86 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.3 
 
 
477 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  27.71 
 
 
406 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.62 
 
 
669 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.7 
 
 
453 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  29.9 
 
 
494 aa  87.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  22.68 
 
 
483 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.57 
 
 
377 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  29.7 
 
 
395 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  31.28 
 
 
380 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.77 
 
 
514 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  32.46 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.71 
 
 
588 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.58 
 
 
567 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.5 
 
 
5698 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.98 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  32.35 
 
 
681 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.21 
 
 
658 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  27.83 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.27 
 
 
496 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.61 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.1 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.56 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.56 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.56 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  29.18 
 
 
778 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.14 
 
 
505 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.56 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.78 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  27.66 
 
 
1037 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  34.36 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.07 
 
 
544 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  29.63 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.33 
 
 
966 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  23.56 
 
 
1055 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  23.92 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.43 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  26.74 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.27 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.84 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.28 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.63 
 
 
650 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.23 
 
 
574 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  30.73 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.27 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.16 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.05 
 
 
1032 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  27.9 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.92 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.67 
 
 
633 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  25.84 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.16 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  28.29 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.16 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  27.04 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  27.9 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  32.55 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.987091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  26.75 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.96 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  28.72 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  24.62 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.98 
 
 
601 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  27.8 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>