More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00893 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 		 504 aa  1037    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  39.22 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  38.38 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  38.66 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  38.66 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  37.76 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  38.2 
 
 		 580 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  31.86 
 
 		 507 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.25 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  31.58 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  30.57 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  31.58 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  31.74 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  26.36 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  26.36 
 
 		 374 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  27.22 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  26.61 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  27.22 
 
 		 345 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  28.31 
 
 		 5698 aa  126  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  36.32 
 
 		 285 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  26.61 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  27.74 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  28.3 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.12 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  32.76 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  27.71 
 
 		 365 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.4 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  26.61 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  29.14 
 
 		 677 aa  94  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.67 
 
 		 460 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.16 
 
 		 610 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.75 
 
 		 669 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  23.98 
 
 		 711 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.51 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  25.71 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  34.98 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.47 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  30.77 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  23.42 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  23.4 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.27 
 
 		 658 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  30.04 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  25.61 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.21 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  25.45 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  24.94 
 
 		 636 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 630 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.16 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  28.02 
 
 		 695 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.18 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  29.46 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  26.01 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.09 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  25.77 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  22.46 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.49 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  23.97 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.86 
 
 		 966 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  26.14 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  26.38 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.78 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  23.36 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.85 
 
 		 539 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.21 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  24.61 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  25.24 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  21.36 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  27.08 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.55 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  22.5 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.08 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  24.38 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  23.38 
 
 		 543 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  23.38 
 
 		 543 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  24.64 
 
 		 637 aa  67  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  25.32 
 
 		 661 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.8 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  20.32 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.28 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  23.33 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  25.4 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  20.87 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  23.43 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  22.58 
 
 		 834 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.92 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  25.56 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  24.2 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  24.45 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.88 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  28.9 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  24.92 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  24.21 
 
 		 398 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  22.51 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  28.51 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  29.41 
 
 		 459 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.81 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>