More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3510 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  100 
 
 		 380 aa  775    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  49.71 
 
 		 382 aa  355  7.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  45.24 
 
 		 391 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  35.71 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  31.8 
 
 		 555 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  27.62 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  28.61 
 
 		 502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.15 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  37.02 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.71 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.3 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.46 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.34 
 
 		 595 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.56 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.27 
 
 		 513 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  27.67 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.06 
 
 		 513 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.34 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.05 
 
 		 691 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.66 
 
 		 681 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 691 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.24 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 691 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.69 
 
 		 694 aa  89.7  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.15 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.37 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  28.29 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  30.04 
 
 		 588 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.79 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.62 
 
 		 834 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.15 
 
 		 501 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  26.15 
 
 		 694 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  31.28 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  31.4 
 
 		 524 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  28.91 
 
 		 691 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  27.16 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  27.47 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.56 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.65 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  26.97 
 
 		 694 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  27.24 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  29.07 
 
 		 633 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  32.47 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  33.84 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  28.89 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  30.09 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  29.06 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.96 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.74 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  29.76 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  30.21 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.73 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.07 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  30.61 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.75 
 
 		 669 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.72 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.88 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  31.44 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  30.92 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.36 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  26.94 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.53 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.8 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.23 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.23 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  26.73 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.72 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.55 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  31.39 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  34.01 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  29.61 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.56 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.16 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  28.23 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.47 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  29.79 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  33.33 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  25.09 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  27.35 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  26.59 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  29.78 
 
 		 760 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  24.81 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.1 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  26.05 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.39 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  27.91 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.59 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.12 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  25.73 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.9 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.42 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  23.38 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  25.36 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  28.44 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.22 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.74 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  24.29 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.16 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>