More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2901 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  100 
 
 		 760 aa  1538    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  69.92 
 
 		 400 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  62.63 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  62.56 
 
 		 401 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2284  hypothetical protein  63.73 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  60.64 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  53.95 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  50.52 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  49.05 
 
 		 395 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  47.37 
 
 		 395 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  47.79 
 
 		 397 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  52.16 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  51.88 
 
 		 395 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  48.18 
 
 		 419 aa  341  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  46.58 
 
 		 395 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  44.99 
 
 		 395 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  45.55 
 
 		 392 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  46.56 
 
 		 397 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  43.09 
 
 		 437 aa  297  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44235  predicted protein  37.78 
 
 		 397 aa  287  5.999999999999999e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  41.55 
 
 		 410 aa  261  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  37.44 
 
 		 418 aa  256  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  39.84 
 
 		 406 aa  241  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  34.84 
 
 		 415 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  32.91 
 
 		 414 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  31.18 
 
 		 419 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  30 
 
 		 422 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  33.52 
 
 		 454 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  31.59 
 
 		 411 aa  155  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  31.49 
 
 		 411 aa  154  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  31.27 
 
 		 408 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  29.4 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  32.04 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  30.54 
 
 		 445 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  31.37 
 
 		 438 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  29.78 
 
 		 420 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  32.78 
 
 		 414 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  31.25 
 
 		 405 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  31.48 
 
 		 424 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  31.17 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  31.62 
 
 		 405 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  30.54 
 
 		 408 aa  144  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  31.15 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  30.77 
 
 		 420 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  30.77 
 
 		 420 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  32.16 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  29.8 
 
 		 405 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  29.5 
 
 		 382 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  30.72 
 
 		 402 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  29.24 
 
 		 410 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  29.24 
 
 		 417 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  29.47 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  30.77 
 
 		 613 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.84 
 
 		 447 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  29.65 
 
 		 414 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  29.58 
 
 		 407 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  29.97 
 
 		 420 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.77 
 
 		 433 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  29.79 
 
 		 407 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  30.65 
 
 		 436 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.9 
 
 		 407 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  31.9 
 
 		 401 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  31.1 
 
 		 418 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  31.23 
 
 		 401 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  31.23 
 
 		 401 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  34.71 
 
 		 401 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  28.18 
 
 		 430 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  31.23 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  28.72 
 
 		 418 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  29.07 
 
 		 424 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  28.3 
 
 		 417 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  30.03 
 
 		 425 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  25.14 
 
 		 377 aa  129  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  28.89 
 
 		 370 aa  129  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.07 
 
 		 431 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  28.8 
 
 		 407 aa  128  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  29.32 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.41 
 
 		 426 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  31.65 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  29.95 
 
 		 415 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  27.72 
 
 		 444 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  27.37 
 
 		 411 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  29.11 
 
 		 437 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09049  transesterase (LovD), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00920)  28.73 
 
 		 396 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.4 
 
 		 424 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  29.06 
 
 		 423 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  33.45 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 431 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  30.29 
 
 		 440 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  31.65 
 
 		 399 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  29.36 
 
 		 440 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  28.49 
 
 		 422 aa  121  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  30.81 
 
 		 426 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  28.57 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  29.77 
 
 		 400 aa  119  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  33.9 
 
 		 399 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  28.72 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  28.87 
 
 		 372 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  28.35 
 
 		 409 aa  114  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  35.9 
 
 		 389 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>