More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3207 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  725    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  33.91 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  32 
 
 		 555 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  30.35 
 
 		 675 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  29.52 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  27.01 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  26.55 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  37.02 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  26.95 
 
 		 580 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  34.86 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.77 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  35.71 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  24.93 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1037 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.21 
 
 		 513 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  27.27 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 513 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  27.3 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  26.67 
 
 		 463 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  24.21 
 
 		 655 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  27.56 
 
 		 410 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  27.3 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  27.3 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  24.65 
 
 		 513 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.49 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  27.93 
 
 		 471 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.87 
 
 		 504 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.98 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  24.93 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  23.59 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.41 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  29.07 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  25.14 
 
 		 5698 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.12 
 
 		 595 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  25.93 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.29 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  27.72 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.77 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  25.55 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  21.53 
 
 		 620 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  22.66 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.61 
 
 		 793 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  24.57 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  25.55 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  27.18 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.98 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  22.31 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.51 
 
 		 691 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  26.01 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  27.15 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.43 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.43 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.99 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  25.9 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  23.93 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  33.14 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  29.82 
 
 		 694 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  26.44 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  26.09 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.3 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.94 
 
 		 691 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.16 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.16 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.63 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  39.09 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  21.74 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.79 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.16 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  22.78 
 
 		 578 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  24.3 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  23.47 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.16 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.04 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.32 
 
 		 600 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  24.39 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.97 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.4 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  23.63 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  37.14 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.68 
 
 		 559 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  24 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.38 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  28.11 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  26.74 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.67 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  22.11 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.79 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  29.61 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.23 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  22.11 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  23.99 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  23.6 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  23.08 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  25.64 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  24.43 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>