More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1599 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  100 
 
 
382 aa  783    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  49.71 
 
 
380 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  36.51 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  31.32 
 
 
395 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  31.2 
 
 
555 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.27 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  25.58 
 
 
502 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  25.69 
 
 
675 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  35.71 
 
 
357 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.77 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  23.74 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.33 
 
 
519 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  27.87 
 
 
445 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  25.98 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.79 
 
 
513 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.72 
 
 
513 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  23.1 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  27.24 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.62 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  27.15 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  25.54 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.03 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25.2 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.77 
 
 
834 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.2 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.55 
 
 
567 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  22.31 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  23.9 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.86 
 
 
595 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  25.16 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  23.62 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.19 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  23.66 
 
 
715 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.38 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  28.71 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  27.09 
 
 
491 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  27.45 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  25.55 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  23.83 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.04 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  28.57 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.6 
 
 
514 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  27.32 
 
 
1037 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  28.06 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.45 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  23.97 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  23 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  24.32 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  23.64 
 
 
613 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  23.89 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.79 
 
 
517 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  23.79 
 
 
590 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.9 
 
 
530 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  25.67 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  27.72 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.24 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.78 
 
 
461 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  23.28 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  26.6 
 
 
494 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.37 
 
 
351 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  27.27 
 
 
553 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  22.83 
 
 
1032 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.89 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  24.83 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  28.02 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.75 
 
 
526 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.07 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  22.33 
 
 
496 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  22.87 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  32.03 
 
 
396 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.52 
 
 
466 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  31.18 
 
 
423 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.1 
 
 
551 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  22.82 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  21.48 
 
 
460 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  27.16 
 
 
695 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  27.08 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  21.74 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  29.38 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  22.85 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.88 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  23.46 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  22.73 
 
 
477 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  24.33 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.93 
 
 
588 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  27.78 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  25.94 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.35 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  23.35 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  24.18 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  23.9 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  22.35 
 
 
601 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.17 
 
 
529 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  21.97 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  21.63 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.14 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  22.34 
 
 
578 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  27.64 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.987091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  22.56 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  23.17 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>