More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4591 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  100 
 
 		 675 aa  1401    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  37.62 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  31.55 
 
 		 365 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  31.74 
 
 		 391 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  40.64 
 
 		 357 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  31.96 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  28.88 
 
 		 395 aa  144  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  29.15 
 
 		 380 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1037 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.32 
 
 		 463 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  25.69 
 
 		 382 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  28.01 
 
 		 494 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  29.17 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.92 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  26.32 
 
 		 478 aa  104  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.76 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.28 
 
 		 460 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  24.48 
 
 		 410 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.48 
 
 		 1055 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 559 aa  97.4  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.54 
 
 		 480 aa  97.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  24.35 
 
 		 410 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.24 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  34.32 
 
 		 681 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.35 
 
 		 505 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  25.81 
 
 		 507 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.58 
 
 		 513 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  30.16 
 
 		 491 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.4 
 
 		 595 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  25.64 
 
 		 580 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.1 
 
 		 377 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.45 
 
 		 501 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  24.63 
 
 		 456 aa  94.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  23.04 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  23.41 
 
 		 464 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.6 
 
 		 386 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  26.34 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  25.89 
 
 		 390 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  23.55 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.64 
 
 		 513 aa  92.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  32.34 
 
 		 446 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  23.58 
 
 		 410 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  29.29 
 
 		 389 aa  91.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.45 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  30.41 
 
 		 437 aa  91.3  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  30.32 
 
 		 367 aa  90.5  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  29.86 
 
 		 610 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  23.58 
 
 		 620 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.94 
 
 		 848 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.23 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  30.22 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.73 
 
 		 1032 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  28.69 
 
 		 389 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.67 
 
 		 431 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  24.86 
 
 		 476 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  22.51 
 
 		 497 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.95 
 
 		 567 aa  87.8  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  23.62 
 
 		 470 aa  87.4  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.71 
 
 		 578 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.5 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.68 
 
 		 453 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.19 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.5 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  29.44 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.82 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.39 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.81 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  22.28 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.81 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  24.48 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  23.35 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  29.73 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.35 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.53 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  30 
 
 		 383 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.46 
 
 		 498 aa  83.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  28.77 
 
 		 409 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.46 
 
 		 498 aa  83.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  31.18 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  30.85 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  21.28 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.19 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.57 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  28.57 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  29.47 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.41 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.12 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.52 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.21 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.38 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.74 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  26.44 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.68 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  29.41 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  25.89 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  26.69 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.8 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  27.62 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  27.62 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>