More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0498 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  100 
 
 		 502 aa  1027    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  31.82 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  35.97 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  35.03 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  31.96 
 
 		 675 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  31.02 
 
 		 555 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  28.61 
 
 		 380 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  25.58 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  26.55 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.66 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.05 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  27.54 
 
 		 345 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.97 
 
 		 595 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.75 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  27.54 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.16 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.75 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 374 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  27.25 
 
 		 345 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6175  hypothetical protein  32.05 
 
 		 252 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 345 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1037 aa  93.6  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 345 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  27.38 
 
 		 345 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  27.25 
 
 		 345 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0386  hypothetical protein  34.06 
 
 		 159 aa  89.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  25.94 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  24.19 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  23.73 
 
 		 389 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  28.33 
 
 		 501 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  24.85 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.92 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.64 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  22.39 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.39 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.08 
 
 		 378 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.09 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  22.8 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  24.01 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  24.1 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.88 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.02 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.1 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  24.93 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  24.58 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.43 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.08 
 
 		 543 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.08 
 
 		 543 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.45 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.71 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.71 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  24.86 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.79 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.7 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.69 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.12 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  25.08 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  24.58 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  25.46 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  21.92 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0499  hypothetical protein  32.53 
 
 		 158 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  22.29 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.8 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.38 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.71 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.5 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  24.76 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  24 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  25.8 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  27.19 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.71 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  23.93 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.38 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.71 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  27.08 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  21.54 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  23.12 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  24.92 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.18 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  26.5 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.18 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  23.55 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  25.96 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  22.16 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  27.34 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  21.22 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.54 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.32 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.92 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  22.93 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  24.68 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  25.08 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  21.5 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.51 
 
 		 785 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  24 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  23.73 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  24 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  24 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>