More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0612 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  100 
 
 		 391 aa  808    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  44.36 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  45.24 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  36.51 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  31.95 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  31.82 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  32.53 
 
 		 555 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  31.74 
 
 		 675 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  29.75 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 595 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.8 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  26.09 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25.92 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.38 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  28.75 
 
 		 524 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.8 
 
 		 513 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.93 
 
 		 681 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.36 
 
 		 505 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  34.18 
 
 		 491 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25 
 
 		 601 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.17 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.13 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.57 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.33 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  25.21 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  25.21 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.74 
 
 		 362 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.47 
 
 		 464 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.17 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.33 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.14 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.45 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  31.05 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  24.93 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.65 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  24.86 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  25.77 
 
 		 580 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.54 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.18 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.61 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.61 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.93 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.07 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.28 
 
 		 834 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.48 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  27.49 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.58 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.39 
 
 		 669 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.25 
 
 		 691 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  27.25 
 
 		 691 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  26.67 
 
 		 691 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.06 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.61 
 
 		 485 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.61 
 
 		 485 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1037 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.67 
 
 		 691 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.41 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.67 
 
 		 691 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.12 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.37 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.45 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  26.72 
 
 		 507 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.61 
 
 		 504 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.74 
 
 		 588 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30 
 
 		 567 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.62 
 
 		 848 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  26.19 
 
 		 610 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  28.03 
 
 		 531 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.73 
 
 		 477 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.74 
 
 		 559 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  29.61 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.98 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  27.93 
 
 		 694 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  25.29 
 
 		 456 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.88 
 
 		 480 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  26.46 
 
 		 691 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.77 
 
 		 526 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  26.89 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  25.6 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.78 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  28.46 
 
 		 431 aa  92.8  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.11 
 
 		 498 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.11 
 
 		 498 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.82 
 
 		 466 aa  92.8  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.15 
 
 		 514 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  25.49 
 
 		 711 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  26.13 
 
 		 536 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  27.09 
 
 		 694 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  24.25 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.52 
 
 		 530 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  27.92 
 
 		 503 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.8 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  26.14 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  22.28 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  26.76 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  28.85 
 
 		 694 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  26.1 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  29.24 
 
 		 590 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>