More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0674 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  100 
 
 		 715 aa  1454    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  37.02 
 
 		 670 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.23 
 
 		 681 aa  242  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  29.3 
 
 		 694 aa  219  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.72 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.36 
 
 		 691 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.36 
 
 		 691 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.56 
 
 		 691 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  27.78 
 
 		 694 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.26 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  25.94 
 
 		 691 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  27.67 
 
 		 694 aa  207  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.51 
 
 		 834 aa  177  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.96 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  31.79 
 
 		 600 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.74 
 
 		 595 aa  160  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.54 
 
 		 601 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  30.65 
 
 		 610 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 588 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.93 
 
 		 966 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.24 
 
 		 711 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  24.94 
 
 		 395 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  31.92 
 
 		 5698 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  24.69 
 
 		 513 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.46 
 
 		 784 aa  105  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.06 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.07 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.07 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  31.82 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  30.53 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  23.77 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.05 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.18 
 
 		 426 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.37 
 
 		 483 aa  101  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.93 
 
 		 574 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.71 
 
 		 480 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.02 
 
 		 530 aa  99.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.59 
 
 		 424 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.15 
 
 		 635 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  29.12 
 
 		 410 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28 
 
 		 498 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  31.7 
 
 		 392 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  29.12 
 
 		 410 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.43 
 
 		 582 aa  97.8  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  29.12 
 
 		 410 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  29.12 
 
 		 410 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  25.51 
 
 		 285 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.46 
 
 		 461 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.24 
 
 		 566 aa  95.9  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  23.36 
 
 		 365 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  27.79 
 
 		 467 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  30.86 
 
 		 466 aa  94.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.57 
 
 		 484 aa  94.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.53 
 
 		 513 aa  94.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.71 
 
 		 637 aa  93.6  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  28.16 
 
 		 446 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  26.63 
 
 		 435 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  24.86 
 
 		 391 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.35 
 
 		 482 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  29.36 
 
 		 460 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.19 
 
 		 416 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  33.79 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.66 
 
 		 464 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  27.98 
 
 		 530 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  33.79 
 
 		 428 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.82 
 
 		 447 aa  91.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.88 
 
 		 822 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.28 
 
 		 486 aa  91.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  27.87 
 
 		 377 aa  92  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  27.38 
 
 		 513 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  26.25 
 
 		 434 aa  92  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.23 
 
 		 450 aa  91.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  31.14 
 
 		 790 aa  91.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.61 
 
 		 430 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.51 
 
 		 453 aa  91.3  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  28.06 
 
 		 398 aa  91.3  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.11 
 
 		 447 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.56 
 
 		 353 aa  90.9  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  26.25 
 
 		 433 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.7 
 
 		 485 aa  90.9  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  26.25 
 
 		 434 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.46 
 
 		 395 aa  90.5  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.63 
 
 		 478 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  25.91 
 
 		 434 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  25.91 
 
 		 434 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.99 
 
 		 459 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  25.83 
 
 		 434 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  39.33 
 
 		 508 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.55 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.21 
 
 		 526 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  34.05 
 
 		 796 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.5 
 
 		 431 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.47 
 
 		 405 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  34.05 
 
 		 796 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  27.92 
 
 		 426 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  29.09 
 
 		 440 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 392 aa  89  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30.17 
 
 		 386 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  35.84 
 
 		 390 aa  89  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.5 
 
 		 539 aa  89  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>