More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4636 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  100 
 
 		 496 aa  1031    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  40.46 
 
 		 364 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  42.57 
 
 		 373 aa  266  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  29.72 
 
 		 483 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.38 
 
 		 578 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.54 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.81 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  29.6 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  29.4 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.81 
 
 		 392 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  33.54 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  27.05 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  33.54 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.24 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  29.03 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.14 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  29.89 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.82 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.63 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  28.42 
 
 		 1055 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  30.24 
 
 		 669 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.45 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.87 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.29 
 
 		 537 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  31.16 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.94 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  23.41 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.97 
 
 		 611 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.42 
 
 		 603 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  28.15 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  28.49 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.66 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.42 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.61 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  29.18 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.22 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.67 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.03 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.51 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.45 
 
 		 363 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.36 
 
 		 446 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.38 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.35 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.09 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.69 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.18 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.93 
 
 		 388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  28.17 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  31.07 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.41 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.7 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.16 
 
 		 353 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.41 
 
 		 388 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.41 
 
 		 388 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.62 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.73 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.62 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.53 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.9 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.92 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.9 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.92 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  28.52 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.48 
 
 		 369 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.13 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.15 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.15 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  28.52 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.4 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.64 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  25.39 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.64 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.48 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  30.22 
 
 		 389 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.79 
 
 		 422 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  25.86 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  24.17 
 
 		 555 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.79 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.56 
 
 		 662 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  30.87 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.76 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  26 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.76 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.81 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.1 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.75 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.54 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.78 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.46 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.67 
 
 		 442 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.99 
 
 		 544 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.96 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.45 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.23 
 
 		 378 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.25 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  26.14 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.6 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>