More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2553 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  100 
 
 		 478 aa  976    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.26 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  25.48 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.82 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  27.61 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.43 
 
 		 578 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.72 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.79 
 
 		 477 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.57 
 
 		 364 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.1 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.84 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.43 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.98 
 
 		 848 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.2 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  28.79 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.62 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  30.22 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.33 
 
 		 369 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.56 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  28.29 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.73 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.6 
 
 		 784 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.05 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.08 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  30.94 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  27.91 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  31.5 
 
 		 395 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  26.49 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.08 
 
 		 377 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.18 
 
 		 793 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  29.75 
 
 		 349 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  27.57 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  27.86 
 
 		 375 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  27.95 
 
 		 374 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  27.57 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.26 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.46 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.87 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  26.71 
 
 		 377 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  26.71 
 
 		 377 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.78 
 
 		 395 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  26.71 
 
 		 377 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.43 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.78 
 
 		 543 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.78 
 
 		 543 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  27.07 
 
 		 416 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  27.16 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  28.81 
 
 		 479 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.88 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  27.61 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.15 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  26.52 
 
 		 375 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25 
 
 		 388 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.82 
 
 		 514 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  28.66 
 
 		 560 aa  93.2  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.6 
 
 		 399 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.64 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.16 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.33 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  28.19 
 
 		 396 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  26.75 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  24.68 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.84 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.34 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.38 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.23 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  28.67 
 
 		 395 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.7 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  33.21 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.08 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  29.48 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  27.81 
 
 		 462 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  32.4 
 
 		 395 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.42 
 
 		 603 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  24.59 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  32.67 
 
 		 524 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  25.38 
 
 		 385 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  25.42 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.42 
 
 		 389 aa  90.1  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.66 
 
 		 422 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.52 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  29.76 
 
 		 429 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  25.42 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  27.31 
 
 		 338 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.05 
 
 		 611 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.66 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.54 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.64 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  29.45 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.53 
 
 		 593 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.52 
 
 		 681 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.81 
 
 		 371 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  26.43 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  26.48 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  28.04 
 
 		 345 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.93 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  28.04 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.04 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.85 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>