More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4110 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  100 
 
 
379 aa  786    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  86.28 
 
 
375 aa  676    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  97.89 
 
 
378 aa  767    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  91.56 
 
 
378 aa  728    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  91.29 
 
 
378 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  77.57 
 
 
376 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  60.42 
 
 
375 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  61.05 
 
 
377 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  60.16 
 
 
377 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  60.53 
 
 
377 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  59.89 
 
 
377 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  59.89 
 
 
377 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  60.95 
 
 
375 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  59.89 
 
 
377 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  60.69 
 
 
375 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  60.32 
 
 
375 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  35.62 
 
 
416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  41.56 
 
 
413 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  37.4 
 
 
404 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  41.23 
 
 
422 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  40.91 
 
 
421 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  40.91 
 
 
413 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  40.91 
 
 
421 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  40.91 
 
 
412 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  40.91 
 
 
412 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  41.23 
 
 
415 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  40.91 
 
 
416 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.04 
 
 
578 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.72 
 
 
392 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.91 
 
 
487 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.99 
 
 
442 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  34.84 
 
 
446 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.91 
 
 
445 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  31.97 
 
 
400 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  33.2 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.93 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  28.53 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  28.93 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.79 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.61 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  27.3 
 
 
603 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.91 
 
 
593 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.13 
 
 
482 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.67 
 
 
611 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.17 
 
 
446 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  30.32 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.3 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  29.71 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.31 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.07 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.09 
 
 
848 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.62 
 
 
362 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  29.64 
 
 
349 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.37 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  30.53 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  30.53 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.01 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.01 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.15 
 
 
308 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  29.06 
 
 
419 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.82 
 
 
356 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  34.29 
 
 
416 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.26 
 
 
406 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.84 
 
 
363 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.37 
 
 
477 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  26.92 
 
 
338 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  27.56 
 
 
369 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.67 
 
 
342 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.87 
 
 
367 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.85 
 
 
445 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.17 
 
 
378 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.16 
 
 
595 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  29.01 
 
 
462 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  26.15 
 
 
415 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.56 
 
 
330 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.33 
 
 
378 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.71 
 
 
338 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  25.39 
 
 
370 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  25.86 
 
 
713 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  27.34 
 
 
405 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  26.1 
 
 
321 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.11 
 
 
498 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.74 
 
 
364 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.48 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  25.69 
 
 
476 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  23.28 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.26 
 
 
388 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.26 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.26 
 
 
388 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  27.48 
 
 
351 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  30.8 
 
 
662 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  26.69 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.53 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.26 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.54 
 
 
388 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.2 
 
 
657 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  24.17 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  25.27 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.92 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  25.27 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>