More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1627 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  100 
 
 
378 aa  767    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0453  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  35.44 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  30.68 
 
 
376 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.12 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.95 
 
 
375 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  26.68 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  27.45 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  27.45 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  26.8 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  29.37 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  28.34 
 
 
377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  28.34 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  28.34 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  28.34 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  28.94 
 
 
378 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  30.49 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  27.97 
 
 
379 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  27.97 
 
 
378 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.82 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.16 
 
 
446 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  31.97 
 
 
442 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.45 
 
 
404 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.35 
 
 
413 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.03 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.63 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.63 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.63 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.63 
 
 
412 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.63 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.13 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  23.7 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.35 
 
 
446 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.67 
 
 
578 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25.48 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.38 
 
 
450 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  26.5 
 
 
451 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.1 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  24.92 
 
 
364 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.28 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  26.54 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  24.09 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  24.54 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  25.88 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  32.54 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  22.86 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  24.33 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  24.33 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  26.48 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.33 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  24.5 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  24.5 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.81 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.25 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  25.57 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  24.17 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  23.74 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  25.17 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  25.07 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1924  beta-lactamase  26.64 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  24.17 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  24.17 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0658  putative lipoprotein  25.49 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  24.78 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  25.17 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.92 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  27.23 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.77 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  28.09 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.25 
 
 
614 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  24.52 
 
 
482 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  26.38 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3080  beta-lactamase  29.91 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  22.43 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  24.62 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.62 
 
 
445 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  21.97 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  22.47 
 
 
848 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  24.47 
 
 
338 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.83 
 
 
611 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  21.66 
 
 
414 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  23.88 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  24.64 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  31.87 
 
 
603 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1459  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  21.24 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.264977  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  22.74 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0093  beta-lactamase, putative  26.98 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.54 
 
 
477 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  25.64 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  21.89 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  24.05 
 
 
525 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  21.45 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.67 
 
 
593 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  21.47 
 
 
559 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  23.85 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  31.18 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  22.68 
 
 
720 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.11 
 
 
595 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>