More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0658 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0658  putative lipoprotein  100 
 
 
383 aa  792    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1459  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  32.05 
 
 
350 aa  166  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.264977  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1924  beta-lactamase  29.41 
 
 
340 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.11 
 
 
308 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  26.47 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  32.58 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0453  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.15 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  29.03 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.12 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  30.05 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.18 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  32.31 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.32 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.49 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.32 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.73 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.99 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.99 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.99 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.99 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0435  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.84 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.57 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.55 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  27.23 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  27.23 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.99 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.25 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.66 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  24.92 
 
 
720 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.82 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  27.32 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.99 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.16 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.3 
 
 
487 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  24.48 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  23.28 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.82 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  23.28 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  27.47 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  23.2 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.28 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  23.28 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  29.81 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  20.83 
 
 
464 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  24.66 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  22.9 
 
 
413 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.93 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.93 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.93 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.93 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  26.2 
 
 
483 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  24.56 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  22.9 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.67 
 
 
848 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.93 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  22.9 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.83 
 
 
559 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.1 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  24.56 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.33 
 
 
498 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  24.56 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  31.21 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.78 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.74 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  24.02 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  22.52 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  23.08 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.87 
 
 
582 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  25.74 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.35 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  29.29 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.2 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.2 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  24.89 
 
 
543 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.21 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.2 
 
 
463 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  25.4 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.26 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.56 
 
 
483 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.47 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.2 
 
 
481 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  28.57 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.8 
 
 
389 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.59 
 
 
385 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.55 
 
 
524 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.56 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  25.4 
 
 
385 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  27.59 
 
 
385 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.82 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  22.42 
 
 
405 aa  59.7  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  25.12 
 
 
792 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  31.21 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>