More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1459 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1459  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  100 
 
 		 350 aa  728    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.264977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1924  beta-lactamase  72.11 
 
 		 340 aa  524  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0658  putative lipoprotein  32.05 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0453  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.6 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  22.1 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  22.46 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  29.06 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.9 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  21.81 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  25.64 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  22.01 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  22.01 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  22.01 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  23.13 
 
 		 792 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.88 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  24.77 
 
 		 593 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  24.5 
 
 		 785 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  21.73 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.83 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.83 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.83 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.66 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  21.39 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  23.67 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  22.01 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  20.83 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  24.83 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.32 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.27 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.09 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.54 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  23.6 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.63 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  24.85 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  24.09 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  24.67 
 
 		 428 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  24.66 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  26.63 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.17 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  23.99 
 
 		 413 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  23.33 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.8 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  21.27 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  27.32 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  24.18 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  23.65 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.37 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  23.17 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  23.86 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  24.85 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  22.26 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.49 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.52 
 
 		 848 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.84 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  26.64 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.91 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.31 
 
 		 720 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  21.24 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.58 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  25.48 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  25.68 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.58 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.57 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  22.36 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  25.88 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  25.88 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.09 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.01 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  24.23 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  18.95 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  24.14 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.89 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  23.84 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  31.21 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  29.63 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.67 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  21.97 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  28.47 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  22.76 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  21.76 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  25.94 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  23.08 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  25.17 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  23.35 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  22.27 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  27.71 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  22.03 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  23.72 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.24 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  21.5 
 
 		 681 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.06 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  23.65 
 
 		 796 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  23.17 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  23.65 
 
 		 796 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  23.01 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  23.18 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  20.11 
 
 		 475 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  23.28 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  22.63 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0435  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.24 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>