More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1814 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  100 
 
 		 308 aa  635    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.82 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  27.24 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 377 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  27.06 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.65 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  28.15 
 
 		 378 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.01 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  27.81 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  27.81 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  27.81 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  28.15 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  28.15 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  25.41 
 
 		 375 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  28.15 
 
 		 378 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  25.84 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  25.84 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  30.64 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25.72 
 
 		 416 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  26 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.05 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  25.4 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.37 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.72 
 
 		 421 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  26.6 
 
 		 397 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  26.6 
 
 		 397 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.72 
 
 		 412 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.08 
 
 		 421 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.72 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.08 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.72 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.14 
 
 		 446 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.12 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.52 
 
 		 446 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0453  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.72 
 
 		 380 aa  92.8  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.57 
 
 		 450 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1924  beta-lactamase  26.51 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0658  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.14 
 
 		 431 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.69 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  33.52 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.69 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.71 
 
 		 578 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  27.59 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  32 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.72 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  32 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  27.69 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  28.14 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.5 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.47 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.79 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  26.74 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.69 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1459  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.9 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.264977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  23.4 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.45 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  25.51 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.38 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  22.78 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  24.63 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.29 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  30.82 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  31.74 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.5 
 
 		 848 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  26.29 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.54 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.24 
 
 		 420 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  25.16 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  24.9 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  23.14 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.46 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  24.32 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  22.64 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.69 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.74 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  24.32 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  25.58 
 
 		 603 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.05 
 
 		 662 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1885  hypothetical protein  26.09 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.33 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  26.85 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.15 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  23.59 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1874  hypothetical protein  25.74 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  24.31 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.26 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  28.65 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.51 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  26.22 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.36 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  28.65 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  25 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.45 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  25.38 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  24.5 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  22.58 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.71 
 
 		 438 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0459  beta-lactamase  28.12 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  23.47 
 
 		 416 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>