More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1924 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1924  beta-lactamase  100 
 
 		 340 aa  711    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1459  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  72.11 
 
 		 350 aa  524  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.264977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0658  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 383 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  26.51 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0453  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.81 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  23.23 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.51 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  24.4 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.66 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.66 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.66 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  20.96 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.66 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.27 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  28.49 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  26.9 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  30.77 
 
 		 790 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  29.14 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.47 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  25.73 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  22.58 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  23.99 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  26.9 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.97 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  23.23 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  23.97 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  26.32 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.81 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  26.64 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.62 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  26.95 
 
 		 785 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  27.88 
 
 		 792 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.57 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  25.68 
 
 		 720 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  24.38 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  24.06 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.75 
 
 		 966 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  24.3 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  23.63 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.17 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.32 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.17 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  30.29 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  21.28 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  22.51 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.2 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.26 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  23.61 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  27.73 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.83 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  22.49 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.24 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  27.81 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  25.14 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.76 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  27.81 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.38 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  26.57 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.72 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  22.75 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  22.38 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  24.41 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  21.22 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  21.01 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.01 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24.29 
 
 		 1032 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.22 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  25.37 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.62 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.62 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.21 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.62 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.62 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.4 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  23.62 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  22.4 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.11 
 
 		 681 aa  62.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.71 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.79 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.48 
 
 		 574 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.38 
 
 		 480 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  30.94 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.2 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  24.14 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  22.44 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  22.64 
 
 		 593 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  24.14 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  23.23 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.37 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.13 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  24.65 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  26.13 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.65 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  25 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.37 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30.28 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>