More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2357 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  100 
 
 
381 aa  779    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  35.74 
 
 
364 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.12 
 
 
848 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  32.32 
 
 
395 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  33.91 
 
 
358 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.69 
 
 
422 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  34.32 
 
 
477 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.09 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.28 
 
 
445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.79 
 
 
410 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.86 
 
 
510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  28.41 
 
 
364 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.45 
 
 
403 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  30.15 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.25 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.78 
 
 
434 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.31 
 
 
325 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.96 
 
 
342 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.95 
 
 
487 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.78 
 
 
537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.73 
 
 
369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.55 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.42 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.76 
 
 
338 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  31.15 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.64 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.93 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.38 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.93 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.76 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.86 
 
 
543 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  24.58 
 
 
611 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.86 
 
 
543 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.45 
 
 
578 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  24.58 
 
 
593 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.04 
 
 
446 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.07 
 
 
453 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  24.79 
 
 
482 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.91 
 
 
369 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  28.76 
 
 
341 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.57 
 
 
513 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  24.42 
 
 
363 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  28.43 
 
 
341 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  28.62 
 
 
340 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.82 
 
 
520 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  36.13 
 
 
431 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  24.36 
 
 
603 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  24.85 
 
 
543 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  28.43 
 
 
340 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  28.43 
 
 
340 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.84 
 
 
467 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  28.43 
 
 
340 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.44 
 
 
378 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.67 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.15 
 
 
388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  28.43 
 
 
348 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.26 
 
 
388 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.29 
 
 
389 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.52 
 
 
388 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.05 
 
 
388 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.83 
 
 
470 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.06 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.16 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.67 
 
 
388 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  26.02 
 
 
483 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.67 
 
 
389 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.67 
 
 
388 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.43 
 
 
463 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.33 
 
 
462 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.5 
 
 
481 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.5 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.5 
 
 
481 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.44 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.34 
 
 
544 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.26 
 
 
519 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.62 
 
 
481 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.45 
 
 
720 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  24.48 
 
 
480 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.4 
 
 
493 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.33 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  22.81 
 
 
567 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27 
 
 
2457 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.75 
 
 
681 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10404  lipoprotein lpqK  24.77 
 
 
409 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  28.92 
 
 
321 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  26.71 
 
 
333 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.37 
 
 
421 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.58 
 
 
508 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.43 
 
 
481 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.37 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.15 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  26.5 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.43 
 
 
483 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.6 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.37 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  22.48 
 
 
507 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  24.28 
 
 
412 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4632  beta-lactamase  27.43 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0925307  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.78 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>