More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1906 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  100 
 
 		 369 aa  758    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  37.85 
 
 		 487 aa  222  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  36.97 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  34.6 
 
 		 593 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  35.14 
 
 		 603 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  32.54 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  35.2 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  34.32 
 
 		 611 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.72 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.75 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.29 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.66 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  32.46 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.41 
 
 		 848 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.77 
 
 		 477 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  30.54 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.56 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.11 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  32.08 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  31.34 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.56 
 
 		 421 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 412 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.25 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  31.13 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.78 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  33.85 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.62 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  29.79 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  33.2 
 
 		 378 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.26 
 
 		 470 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  28.3 
 
 		 415 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  33.2 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.31 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.52 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.9 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  28.82 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.61 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  32.82 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.16 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.31 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  28.8 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  32.55 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  30.31 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  27.74 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  31 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  28.84 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.86 
 
 		 543 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.86 
 
 		 543 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  27.42 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  29.81 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  28.67 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.14 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  32.44 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.82 
 
 		 537 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.06 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  26.6 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  26.6 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  28.21 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  29.15 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  27.65 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.94 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  27.73 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  26.24 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.49 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  29.04 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 559 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  27.04 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.74 
 
 		 450 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  33.74 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1527  beta-lactamase  29.21 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.129016  normal  0.599812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  32.14 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.5 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.23 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.47 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  27.73 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.79 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  29.34 
 
 		 514 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  28.33 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  30.19 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.74 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  26.2 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.48 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  26.67 
 
 		 496 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.23 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  30.86 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  30.86 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.86 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  30.86 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.33 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.68 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>