More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0428 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  75.96 
 
 
416 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  75.3 
 
 
413 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  100 
 
 
404 aa  832    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  73.54 
 
 
421 aa  624  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  73.79 
 
 
421 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  74.58 
 
 
422 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  73.54 
 
 
412 aa  624  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  73.37 
 
 
413 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  73.3 
 
 
412 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  74.28 
 
 
416 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  72.77 
 
 
415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  37.63 
 
 
375 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  38.76 
 
 
375 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  39.02 
 
 
377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  38.38 
 
 
375 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  38.12 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  43.04 
 
 
377 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  43.04 
 
 
377 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  43.04 
 
 
377 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  43.04 
 
 
377 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  38.28 
 
 
376 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  38.58 
 
 
377 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  37.92 
 
 
378 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  38.44 
 
 
378 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  37.8 
 
 
378 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  42.21 
 
 
379 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  38.95 
 
 
375 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  34.15 
 
 
487 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.42 
 
 
392 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  35.71 
 
 
446 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  34.17 
 
 
434 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  34.34 
 
 
578 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.16 
 
 
446 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.14 
 
 
477 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.85 
 
 
445 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.09 
 
 
442 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.1 
 
 
848 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.5 
 
 
593 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  30.5 
 
 
417 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.75 
 
 
611 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  33.33 
 
 
510 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  31.76 
 
 
325 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.88 
 
 
603 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.21 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.69 
 
 
377 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  32.36 
 
 
343 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.52 
 
 
369 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.18 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.62 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.38 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.91 
 
 
410 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  33.11 
 
 
362 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.77 
 
 
356 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  30.14 
 
 
321 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.74 
 
 
450 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  26.05 
 
 
482 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  31.03 
 
 
442 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  32 
 
 
342 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  27.95 
 
 
400 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  30.65 
 
 
419 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.49 
 
 
720 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.49 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  27.97 
 
 
363 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.89 
 
 
470 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.43 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  29.61 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  29.61 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.6 
 
 
543 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.09 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.6 
 
 
543 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  33 
 
 
416 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.63 
 
 
364 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  34.67 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  29.72 
 
 
361 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  27.25 
 
 
713 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.62 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  29.55 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.69 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.79 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  28.41 
 
 
394 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.94 
 
 
497 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  26.89 
 
 
415 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.68 
 
 
537 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.1 
 
 
370 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  29.85 
 
 
402 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.87 
 
 
407 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  25.71 
 
 
790 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  26.51 
 
 
338 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.82 
 
 
330 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  27.52 
 
 
476 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.23 
 
 
385 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  32.59 
 
 
662 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.03 
 
 
338 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  28.87 
 
 
507 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  24.78 
 
 
498 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.39 
 
 
388 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.39 
 
 
388 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.57 
 
 
428 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.57 
 
 
452 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  30.15 
 
 
483 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>