More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1072 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  100 
 
 		 412 aa  854    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  34.67 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.01 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  35.64 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.98 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.63 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  30.38 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.38 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  30.38 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.89 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  30.38 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  32 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  32.63 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.92 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  33.33 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.11 
 
 		 388 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.4 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  32.31 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.08 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.8 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.7 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.02 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.16 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  31.87 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  31.87 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  31.87 
 
 		 388 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.87 
 
 		 388 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  31.49 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.46 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.39 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  30.15 
 
 		 2457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.68 
 
 		 429 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.36 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  30.38 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.96 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.38 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.78 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.01 
 
 		 371 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  29.01 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.73 
 
 		 740 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.94 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  29.7 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.66 
 
 		 720 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.77 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.79 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.32 
 
 		 713 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.97 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  28.22 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.29 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.13 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.96 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.65 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.29 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.29 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.29 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  28.21 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.02 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  30.57 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.75 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  26.1 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.76 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  28.57 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.94 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  28.47 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  27.91 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.7 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  27.64 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.29 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.27 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.14 
 
 		 487 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  26.54 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.02 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.54 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  29.53 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  27.69 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.95 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.67 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.86 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.98 
 
 		 514 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.95 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29 
 
 		 521 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  29.63 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  29.03 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.01 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  27.69 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.59 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.65 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.96 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  27.61 
 
 		 341 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.11 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  27.37 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  27.01 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  24.49 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  31.25 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.34 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.55 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  25.77 
 
 		 340 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>