More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 521 aa  1025    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  32.95 
 
 		 501 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  32.13 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  32.23 
 
 		 401 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.97 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  29 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.57 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.15 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  32.36 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.51 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.65 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.65 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.61 
 
 		 443 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  31.42 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  31.87 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.99 
 
 		 356 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  28.83 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.72 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.05 
 
 		 385 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.72 
 
 		 385 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.72 
 
 		 375 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  32.11 
 
 		 450 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  30.47 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.27 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.92 
 
 		 713 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.53 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.47 
 
 		 593 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.47 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.05 
 
 		 385 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.69 
 
 		 395 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.3 
 
 		 505 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  30.52 
 
 		 457 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.78 
 
 		 438 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  34.48 
 
 		 370 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  28.15 
 
 		 496 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.21 
 
 		 603 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.63 
 
 		 371 aa  93.6  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  28.44 
 
 		 740 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.32 
 
 		 611 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.14 
 
 		 385 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  30.5 
 
 		 463 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.31 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.24 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0435  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.4 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  24.48 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.56 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.5 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  31.27 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.4 
 
 		 388 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  29.01 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.96 
 
 		 388 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.57 
 
 		 405 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.17 
 
 		 529 aa  90.1  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.39 
 
 		 544 aa  90.1  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.34 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.22 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.75 
 
 		 351 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.27 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.27 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.7 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.27 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  27.94 
 
 		 471 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.95 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.57 
 
 		 405 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.27 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.57 
 
 		 405 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.37 
 
 		 388 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.97 
 
 		 720 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.14 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  25 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  26.62 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.02 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.32 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.32 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.55 
 
 		 388 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.32 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  36.84 
 
 		 462 aa  87.8  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.32 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  28.57 
 
 		 407 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  31.86 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.06 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.05 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.97 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.95 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.09 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.95 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.42 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.24 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.09 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.15 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.63 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.65 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  27.92 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  35.33 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  31.02 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  30.18 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  31.02 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.18 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  27.64 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>