More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0963 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  100 
 
 		 423 aa  839    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  42.03 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  31.92 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  32.8 
 
 		 513 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.34 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  31.64 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  36.29 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.21 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  33.96 
 
 		 580 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  34.38 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  31.89 
 
 		 410 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  31.05 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.41 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  31.27 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.19 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  31.27 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  31.89 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  30.46 
 
 		 507 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  31.88 
 
 		 657 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  32.73 
 
 		 677 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  32.03 
 
 		 674 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 5698 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  29.6 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  32.08 
 
 		 635 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  34.29 
 
 		 507 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  37.56 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  29.15 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  31.15 
 
 		 601 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  34 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.51 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.46 
 
 		 487 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  33.21 
 
 		 695 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.63 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  32.09 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.8 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.4 
 
 		 595 aa  96.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.54 
 
 		 480 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.72 
 
 		 514 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.19 
 
 		 533 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.29 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.11 
 
 		 669 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  28.74 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  32.22 
 
 		 530 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.07 
 
 		 658 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  32.36 
 
 		 478 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  29.18 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  31.33 
 
 		 451 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.48 
 
 		 510 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  32.31 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  33.19 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  31.73 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.75 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  27.6 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.57 
 
 		 790 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  33.76 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.37 
 
 		 501 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  28.57 
 
 		 715 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  30.24 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.44 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.93 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  34 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.57 
 
 		 498 aa  90.9  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.9 
 
 		 483 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  31.63 
 
 		 711 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.04 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 691 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  34 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  34 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  28.88 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  34.16 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  30.03 
 
 		 330 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  28.96 
 
 		 691 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  33.19 
 
 		 478 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  31.02 
 
 		 661 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  20.93 
 
 		 505 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.37 
 
 		 559 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.89 
 
 		 691 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  34 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  32.02 
 
 		 633 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.13 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  38.6 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  33.54 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.74 
 
 		 834 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  38.6 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 481 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.24 
 
 		 588 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.42 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  33.79 
 
 		 616 aa  88.2  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  31.15 
 
 		 511 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.8 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.74 
 
 		 498 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.1 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.49 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.74 
 
 		 498 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.49 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 691 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>