More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0388 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  100 
 
 		 392 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  43.54 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  43.54 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  40.67 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  40.66 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  41.88 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  44.6 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  37.63 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  38.86 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  39.77 
 
 		 388 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  38.98 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  39.12 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  35.92 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  35.49 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  38.23 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  38.33 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  38.23 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  37.95 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  37.95 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  37.95 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  37.53 
 
 		 385 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  38.23 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  33.8 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  37.95 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  37.67 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  35.6 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  36.01 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  36.01 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  36.62 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  31.07 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  36.62 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  38.14 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  37.68 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  32.99 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  39.44 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  36.95 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  33.8 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  39.44 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  37.85 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  37.85 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  33.62 
 
 		 394 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  34.17 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  36.47 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  36.54 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  33.33 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  33.33 
 
 		 417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  36.52 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  32.76 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  32.67 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  32.76 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  39.33 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  37.57 
 
 		 380 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  38.66 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  37.06 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  30.92 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  38.08 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  29.02 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.29 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.72 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.96 
 
 		 460 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.33 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  23.08 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.6 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  24.19 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  23.35 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  32.02 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  30.3 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  30.33 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  29.22 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  22.28 
 
 		 1055 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  27.74 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  24.78 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  30.34 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.11 
 
 		 481 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.21 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.11 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  34.24 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.11 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  31.3 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.44 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.52 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  20.47 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.99 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  30.3 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  30.15 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  20.16 
 
 		 475 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  22.82 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.66 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  22.13 
 
 		 1032 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  25.51 
 
 		 720 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.77 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  23.81 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  22.41 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.52 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  19.18 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.91 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.36 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.76 
 
 		 650 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.36 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.12 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>