More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1414 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  100 
 
 		 399 aa  829    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  46.88 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  46.6 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  47.38 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  47.55 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  41.36 
 
 		 426 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  38.54 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  37.39 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  37.76 
 
 		 377 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  36.81 
 
 		 455 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  36.52 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  36.97 
 
 		 466 aa  229  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  35.84 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  37.54 
 
 		 444 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  30.88 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  28.69 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  26.5 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.06 
 
 		 520 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.07 
 
 		 485 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.5 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.14 
 
 		 526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.43 
 
 		 485 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.21 
 
 		 485 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.18 
 
 		 529 aa  126  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.36 
 
 		 485 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.36 
 
 		 485 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.68 
 
 		 485 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.71 
 
 		 567 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.78 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.41 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.74 
 
 		 591 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 485 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.99 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.67 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.55 
 
 		 803 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.37 
 
 		 681 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.12 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  24.67 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  23.35 
 
 		 519 aa  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  26.9 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  25 
 
 		 523 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.65 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.38 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.65 
 
 		 559 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  23.15 
 
 		 566 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.28 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  25.47 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.38 
 
 		 1032 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  25 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  25.2 
 
 		 551 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  22.04 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  22.31 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  23.73 
 
 		 822 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  29.75 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  25.36 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  26.53 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  24.1 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  23.98 
 
 		 655 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.37 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.37 
 
 		 481 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.37 
 
 		 481 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.79 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.59 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.63 
 
 		 514 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.75 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  26.86 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.75 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.18 
 
 		 481 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  26.39 
 
 		 531 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.21 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.7 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  23.56 
 
 		 517 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  24.93 
 
 		 533 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.55 
 
 		 720 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.92 
 
 		 505 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  21.9 
 
 		 620 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  24.78 
 
 		 536 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  26.69 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  22.25 
 
 		 601 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.65 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.66 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  24.44 
 
 		 462 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  23.47 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  22.74 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  23.74 
 
 		 711 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.61 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  26.49 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  26.87 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  26.89 
 
 		 519 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  23.84 
 
 		 482 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.92 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.07 
 
 		 508 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  23.84 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  24.29 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.63 
 
 		 490 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  22.06 
 
 		 519 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  25.16 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  23.76 
 
 		 498 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>