More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0735 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  100 
 
 		 551 aa  1110    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  56.65 
 
 		 562 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  54.22 
 
 		 531 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  56.53 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  57.2 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  57 
 
 		 533 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  57 
 
 		 533 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  52.38 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  54.71 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  49.7 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  48.11 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  47.76 
 
 		 531 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  47.44 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  42.88 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  42.57 
 
 		 544 aa  362  9e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  46.71 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  42.68 
 
 		 550 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  38.91 
 
 		 519 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  38.51 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  35.51 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  35.46 
 
 		 455 aa  225  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  31.22 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.65 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.85 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.1 
 
 		 803 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.72 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  32.45 
 
 		 567 aa  170  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.21 
 
 		 529 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  28.14 
 
 		 523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.54 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.06 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.64 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.06 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.06 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.06 
 
 		 485 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  28.76 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.59 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  28.25 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.23 
 
 		 485 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.17 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.78 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.62 
 
 		 591 aa  158  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.28 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.65 
 
 		 526 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.83 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.25 
 
 		 517 aa  140  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.82 
 
 		 566 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  29.57 
 
 		 603 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  29.13 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  28.17 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  29.94 
 
 		 620 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  28.86 
 
 		 655 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  31.04 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  28.33 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  28.16 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  27.6 
 
 		 455 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.72 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  23.39 
 
 		 380 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.32 
 
 		 385 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.34 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.41 
 
 		 385 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.2 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.93 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  29.65 
 
 		 822 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.37 
 
 		 717 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.06 
 
 		 601 aa  100  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.06 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  27 
 
 		 444 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.55 
 
 		 595 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.75 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  23.39 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  27.03 
 
 		 445 aa  94  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  27.88 
 
 		 369 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  24.58 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  27.11 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.22 
 
 		 384 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.63 
 
 		 505 aa  90.1  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.63 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  21.1 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.28 
 
 		 362 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  21.1 
 
 		 481 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.42 
 
 		 600 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  21.68 
 
 		 481 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  21.1 
 
 		 481 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  21.68 
 
 		 481 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.01 
 
 		 437 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.46 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  23.21 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  27.27 
 
 		 637 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.75 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.74 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.38 
 
 		 480 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  24.33 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  25.77 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  20.71 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  26.63 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  23.67 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.66 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  25.6 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>