More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4706 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  100 
 
 		 444 aa  907    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  51.13 
 
 		 445 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  35.82 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  35.28 
 
 		 455 aa  226  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  35.28 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  35.38 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  37.54 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  34 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  36.51 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  34.88 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  32.85 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  35.59 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  34.26 
 
 		 359 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  37.22 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  30.03 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  35.14 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.72 
 
 		 513 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.41 
 
 		 567 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.49 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.79 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.21 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  29.53 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  30.13 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.31 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  24.93 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.21 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.21 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.21 
 
 		 485 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.41 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.07 
 
 		 803 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.68 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.62 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.36 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.14 
 
 		 591 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.21 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.21 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.36 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  30.81 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  29.03 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.92 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.15 
 
 		 498 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.98 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.98 
 
 		 497 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.24 
 
 		 519 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.51 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  28.9 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.53 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  30.31 
 
 		 519 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  30.61 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.96 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  30.54 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.65 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  27 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.35 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  30.7 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30.1 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30.1 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  31.12 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  28.82 
 
 		 517 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.3 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  30.26 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  29.46 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  26.99 
 
 		 547 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.81 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.74 
 
 		 483 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.56 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.57 
 
 		 475 aa  96.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  28.69 
 
 		 533 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  28.69 
 
 		 533 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  28.69 
 
 		 533 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  30.22 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25 
 
 		 620 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.33 
 
 		 822 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.71 
 
 		 514 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  30 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.9 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.25 
 
 		 635 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  25.51 
 
 		 566 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.93 
 
 		 520 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  28.57 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.87 
 
 		 595 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.38 
 
 		 442 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  25.36 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.65 
 
 		 601 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.93 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  25.89 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  25.42 
 
 		 655 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.56 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  25.31 
 
 		 478 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  24.3 
 
 		 480 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.19 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.31 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.61 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  29.15 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  24.46 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  27.92 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.68 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  27.11 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  24.6 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>