More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1551 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  100 
 
 		 375 aa  771    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  30.82 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  31.08 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  31.07 
 
 		 370 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  29.2 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.57 
 
 		 966 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.08 
 
 		 574 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  38.69 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.38 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  38.69 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  24.55 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  29.7 
 
 		 785 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  25.68 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  25.6 
 
 		 420 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  39.42 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  34.3 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  33.9 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  28.44 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  32.68 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  30.52 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  33.14 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  37.96 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  33.9 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28 
 
 		 793 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  29.22 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.16 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.55 
 
 		 784 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  35.46 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  30.92 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  36.5 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  25.75 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.03 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.4 
 
 		 582 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  28.02 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.49 
 
 		 792 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  35.97 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  35.77 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.95 
 
 		 424 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  28.99 
 
 		 796 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  26.48 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  27.22 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  28.99 
 
 		 796 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  25.59 
 
 		 420 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  26.23 
 
 		 471 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  25.32 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  24.85 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  39.22 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.47 
 
 		 717 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  25.32 
 
 		 483 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.54 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  23.87 
 
 		 420 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  40 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.7 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  23.87 
 
 		 420 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  33.93 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  26.2 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  25.3 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  33.81 
 
 		 578 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.57 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  24.86 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  32.35 
 
 		 452 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  29.63 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.97 
 
 		 483 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  28.66 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.04 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  26.07 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  26.91 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  25.92 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.72 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.62 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.41 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  28.21 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  25.67 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  26.33 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  27.96 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  28.44 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  32.94 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  38.46 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  25.92 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  25.92 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.62 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  25.92 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  26.07 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  29.46 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  35 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  31.72 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  31.03 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  33.33 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  31.03 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.03 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  25.53 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  24.62 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  31.03 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.03 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  33.09 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>