238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0993 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0993  beta-lactamase  100 
 
 
312 aa  617  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.65 
 
 
640 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.78 
 
 
530 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  24.89 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25.72 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  23.95 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.36 
 
 
363 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  25.58 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.13 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.92 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  26.57 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.7 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  24.39 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  21.48 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  22.83 
 
 
503 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  21.48 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  20.76 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.44 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  25.09 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  24.73 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  24.07 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.63 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  25.19 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  20.4 
 
 
487 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  26.47 
 
 
475 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  25.5 
 
 
504 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  26.86 
 
 
449 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  27.13 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.13 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  25.3 
 
 
475 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  23.79 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  25.88 
 
 
472 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  21.32 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.81 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  22.44 
 
 
470 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  25.58 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  29.6 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  23.46 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  31.58 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.19 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  21.29 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.38 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  22.34 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  23.53 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  25.28 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  22.46 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.25 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.78 
 
 
578 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  25.15 
 
 
428 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  22.22 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  21.38 
 
 
389 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  21.07 
 
 
432 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  20.55 
 
 
337 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.8 
 
 
362 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.18 
 
 
387 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.38 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  22.99 
 
 
335 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  23.96 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  23.76 
 
 
462 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  28.03 
 
 
501 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  22.5 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.37 
 
 
382 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.57 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  22.41 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.21 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.31 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.21 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  23.21 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  19.25 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  22.98 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  23.21 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  22.34 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  24.15 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  23.68 
 
 
475 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  20.7 
 
 
582 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  25.44 
 
 
453 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.15 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  21.92 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.49 
 
 
371 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.73 
 
 
550 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  22.69 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  24.59 
 
 
616 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  22.85 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.4 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  22.54 
 
 
456 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  25.29 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.85 
 
 
371 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  22.22 
 
 
374 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  22.56 
 
 
367 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  24.67 
 
 
342 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.78 
 
 
434 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  21.83 
 
 
476 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.46 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.48 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.44 
 
 
446 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>