More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 550 aa  1060    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  43.91 
 
 		 475 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.43 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  38.06 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  37.75 
 
 		 456 aa  178  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  32.37 
 
 		 457 aa  170  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.67 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  33.87 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.25 
 
 		 453 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.75 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  31.61 
 
 		 450 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.29 
 
 		 559 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.6 
 
 		 578 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.76 
 
 		 519 aa  97.4  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.87 
 
 		 369 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.73 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  33.33 
 
 		 441 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.66 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.02 
 
 		 443 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.96 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.55 
 
 		 389 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.62 
 
 		 442 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.27 
 
 		 388 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.92 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.92 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.92 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.92 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.79 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 		 389 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  26.41 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  29.53 
 
 		 454 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  28.91 
 
 		 449 aa  90.5  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.72 
 
 		 388 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.48 
 
 		 501 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.38 
 
 		 681 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.25 
 
 		 385 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.3 
 
 		 389 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.78 
 
 		 434 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.37 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  35.57 
 
 		 370 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.08 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.25 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.98 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.41 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.82 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.25 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.3 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.36 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  29.43 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  31.14 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.64 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.26 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.97 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.67 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.31 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.46 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.46 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.34 
 
 		 375 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.46 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.8 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  30.82 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.06 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.46 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  28.4 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.09 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.34 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.72 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.4 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  22.87 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.08 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.51 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.15 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  37.66 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  28.96 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.89 
 
 		 601 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  31.1 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  34.43 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  25.99 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  30.29 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.5 
 
 		 380 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.75 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  28.26 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.35 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.46 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  29.23 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.5 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  29.56 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  30.75 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  28.32 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.05 
 
 		 593 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  34.26 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.63 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  24.92 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.09 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  24.18 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.04 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  29.32 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  32.95 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>